Technische Assistenz (d/w/m) Projektunterstützung zur RNA-Forschung in der Kinderonkologie

Das Ped RNA Lab von Dr. Steffen Fuchs ist die Forschungsgruppe unserer Klinik für RNA-basierte Tumorbiologie. Dr. Fuchs ist Kinderonkologe und Clinician Scientist und arbeitet zwischen Patientenbetreuung und Forschung. Dadurch bleiben unsere Fragestellungen immer eng an den Bedürfnissen der Patientinnen und Patienten. 

Wir untersuchen, wie fehlregulierte RNA-Moleküle zu Entstehung, Aggressivität und Therapieresistenz kindlicher Tumoren wie dem Neuroblastom, der akuten lymphatischen Leukämie und Hirntumoren beitragen. In unserem interdisziplinären Team verbinden wir Laborforschung, klinische Forschung, künstliche Intelligenz und bioinformatische Analysen. Unser Ziel sind neue Biomarker, etwa aus Liquid Biopsies, für die frühzeitige Erkennung von Rückfällen sowie neue RNA-basierte Therapieansätze. Dabei kooperieren wir eng mit Partnern am Max Delbrück Center in Berlin und mit Forschungsgruppen in Barcelona, Paris und Gent.

Als Forschungs-TA unterstützen Sie die laufenden Projekte unserer Nachwuchsarbeitsgruppe und führen selbstständig Experimente in der Zell- und Molekularbiologie durch. Wir arbeiten eng mit den chirurgischen Kliniken zusammen und verarbeiten regelmäßig primäre Patientenproben direkt aus dem OP. Ihre Arbeit erfordert ein hohes Maß an Sorgfalt und Organisationsfähigkeit.

Zu den Aufgaben gehören:

• Sie führen eigenständig molekularbiologische Arbeiten durch: Extraktion von DNA und RNA aus Tumorgewebe, Blutplasma und Zellkulturen, verschiedene PCR-Verfahren, Primer-Design, Klonierung und Probenvorbereitung für die Sequenzierung
• Sie kultivieren Tumorzellen (ggf. auch Organoide aus Patientenmaterial) und führen funktionelle Assays (FACS, Incucyte), Knockdown- und Knockout-Experimente (siRNA, shRNA, CRISPR/Cas9) sowie Western Blots durch
• Sie nehmen primäre Patientenproben direkt aus dem OP entgegen und bereiten Gewebe und weitere Proben im Labor auf und führen histologische Analysen durch
• Sie etablieren neue Methoden, recherchieren hierfür in der wissenschaftlichen Literatur (z.B. PubMed), optimieren bestehende Abläufe und SOPs und dokumentieren (digitales Laborbuch) und werten Ihre Experimente strukturiert aus
• Sie organisieren das Labor (Bestellungen über SRM) und leiten Praktikantinnen/Praktikanten sowie Doktorandinnen/Doktoranden an und arbeiten sie ein
• Sie arbeiten an verschiedenen wissenschaftlichen Projekten mit und sind offen für Kooperationen
• Erfahrungen mit Tierversuchen sind von Vorteil